Шноркель - вещь номер один. 8)
И от воды, и от пыли помогает.
Не забывай, что в корпусе фильтра есть отверстие для слива конденсата - его надо закрыть.
И электрику пролей каким-нибудь лаком влагозащитным - в "Чип-и-дипе" продаются.
Проверь щуп на предмет резинки - не задубела ли.
Посмотри, насколько просто воде попасть в колодцы свечей - резинки силовых проводов пролить силиконом или как-то аналогично улучшить.
Если не планируешь затопление салона - то всё.
Если да - то мозги. Либо пролить тем же лаком (но держи в голове, что они прогреваются - соответственно и лак) - если без фанатизма. Либо перенос куда-нибудь под потолок. 8)
Если под капотом есть блок предов или реле - его тоже герметизировать.
Сапуны можно просто проверить на предмет работоспособности - у многих они забиты и не дышат.
Можно попробовать их вывести куда-нибудь повыше. Но это вопрос, в котором я не до конца определился. 8)