Был анологичный случай с CHRYSLER CIRRUS.
Включалась штатная сигнализация когда хотела, блокировала двигатель, истошно орала, заткнуть ее можно было только сбросив клему с аккумулятора.
Когда она меня затарахтела совсем, отвез ее знакомому сигнализаторщику.
Результат:
Оказалось что штатная сигнализация срабатывала из за плохого контакта в приводе замка передней правой двери.
Решение:
Удалить ее нет возможности, значит нужно использовать. Сделали просто, вывели включение и выключение штатной сигнализации на скрытую кнопку в салоне, вместо брелка. После этого еще год ездил, до продажи , проблем не было.
Обе сигнализации и штатная и что поверх стояла, работали, как по отдельности так и вместе.